Avec 18 280 emplois publics, la zone d'emploi d'Auxerre est la quatrième zone la plus importante de la région, derrière celles de Dijon, Besançon et Belfort-Montbéliard-Héricourt. L'emploi public pèse beaucoup localement puisqu'il représente 23 % de l'emploi total de ce territoire. Il se répartit par tiers dans chacun des versants. Le principal employeur est le centre hospitalier d'Auxerre qui compte 1 860 agents. Les emplois sont un peu moins qualifiés qu'en moyenne régionale : 67 % des agents (hors enseignement) sont employés ou ouvriers : c'est quatre points de plus que dans l'ensemble de la région. La famille regroupant les métiers de l'administration est la plus importante avec 3 540 agents, principalement adjoints et agents administratifs. Viennent ensuite la famille de métiers des soins qui compte 3 350 agents dont près de 90 % sont aides-soignants ou infirmiers et celle de l'éducation avec 3 300 personnes. C'est dans les métiers de l'administration que l'on retrouve le plus de professions communes aux trois versants. La famille de métiers technique-informatique-transports et celle de l'action sociale comptent également des agents dans chacun des versants mais leurs effectifs sont beaucoup plus faibles. Dans l'ensemble de la fonction publique, 17 % des agents sont âgés d'au moins 55 ans ; cette proportion atteint 21 % parmi le personnel territorial. Les seniors sont nombreux dans les métiers de l'administration et du bâtiment-travaux publics où ils représentent 23 % des effectifs. Dans les métiers des services à la personne et des finances publiques, le personnel est moins nombreux mais également âgé : 30 % des agents ont au moins 55 ans.